Dopo i problemi di lag nelle partite online delle versioni Xbox 360 e PC di Pro Evolution Soccer 2008 (corretti con le dovute patch), Konami ha provveduto a rilasciare due update anche per la versione PlayStation 3, uno dedicato alla parte online del gioco, e che corregge i problemi di lag durante appunto le partite via internet, e l’altro dedicato invece alla parte offline, che impedisce che il gioco vada "a scatti" e migliora le funzioni di replay.
I due aggiornamenti sono di circa 130 megabytes ciascuno ed ovviamente sono scaricabili via PlayStation Network.