Midway ha fatto sapere che non verrà più concessa agli utenti PlayStation 3 di parlare tramite cuffie e microfono con altri utenti collegati online; questo "privilegio" sarà appannaggio esclusivo invece degli utenti Xbox 360, che potranno addirittura ascoltare le conversazioni degli avversari standogli vicino nel gioco.
Inoltre ci sarà un'originale modalità simile al Deathmatch, chiamata "Abduction", che prevede lo spostamento dei giocatori di una squadra gradualmente verso l'altra, lasciandone solo pochi che dovranno cavarsela con bonus di vario genere.
BlackSite: Area 51 è atteso ancora per metà novembre su PC, Xbox 360 e PS3.