se i programmi non sono fatti come dio comanda può succedere che eliminando in automatico qualche cosa ti perda che a lungo andare da dei problemi (ccleaner credo per esempio no in quanto non è assolutamente aggressivo come ricerca delle chiavi di registro), però con alcuni softw di pulizia registro se non lo fai in manuale sapendo quello che fai qualche casino te lo possono combinare

purtroppo è la perenne croce di win, finchè non si decideranno a fare un file system decente

comunque io uso ccleaner, regcleaner e perfectdisk defrag per tenere tutto pulito e in ordine e fino ad ora tutto ok